董夢秋 博士
北京生命科學研究所高級研究員
Meng-Qiu Dong, Ph.D. Associate Investigator, NIBS, Beijing, China
Phone:010-80726688-8515
Fax: 010-80706053
E-mail:dongmengqiu@nibs.ac.cn
教育經歷
Education
2001年 |
耶魯大學分子生物物理學與生物化學系博士
Ph.D., Department of Molecular Biophysics & Biochemistry, Yale University, USA |
1995年 |
中國科學院上海生物化學研究所碩士
M.Sc., Shanghai Institute of Biochemistry, Chinese Academy of Sciences, China |
1992年 |
四川大學生物系學士 B.Sc., Department of Biology, Sichuan University, China |
工作經歷
Professional Experience
2015年- |
北京生命科學研究所高級研究員 |
Associate Investigator, National Institute of Biological Sciences, Beijing, China |
|
2007年-2015年 |
北京生命科學研究所研究員 Assistant Investigator, National Institute of Biological Sciences, Beijing, China |
2003年-2007年 |
美國斯克利普斯研究院博士后 Postdoctoral Research Associate, The Scripps Research Institute, USA |
2001年-2003年 |
美國加洲大學圣地亞哥分校醫(yī)學院博士后 Postdoctoral researcher, UCSD School of Medicine, USA |
研究概述
Research Description
本實驗室的研究主題包含生物學和質譜技術兩部分,二者相輔相成,共同發(fā)展。
在生物學研究方面,我們以線蟲為模式生物,試圖了解衰老的生物學過程及其調控機制。在自然衰老過程中,線蟲的轉錄組和蛋白質組將不可避免地發(fā)生一系列變化,借助高通量測序及質譜技術,我們可以對這些變化進行定量分析,并進一步探討這些變化在長壽突變體線蟲與野生型線蟲之間有何不同。衰老過程在細胞器水平(如線粒體)上引起的變化也在我們的關注范圍之內。對這些變化進行分析與歸納可以使我們更加深入地認識衰老過程,并為進一步研究調節(jié)衰老的機制打下堅實的基礎。在衰老的調節(jié)機制的研究中,我們主要關注胰島素信號通路。目前已經知道,從上游的胰島素受體直至下游的FoxO轉錄因子,所有胰島素信號通路的關鍵組分都具有調節(jié)壽命的功能。然而,FoxO轉錄因子可以在轉錄水平調節(jié)一系列靶蛋白,哪些關鍵靶蛋白最終導致了壽命的延長仍不清楚。我們希望找到這些關鍵靶蛋白,通過它們了解胰島素信號通路調節(jié)壽命的奧秘。
在質譜方面,我們致力于基于質譜的蛋白質組學技術的應用與開發(fā),以期為生物學研究提供新的思路與方法。目前,我們實驗室日常的質譜分析工作包括蛋白鑒定、定量蛋白質組學分析以及翻譯后修飾分析。樣品多為免疫沉淀的蛋白復合物或全細胞裂解液。此外,我們與所內外其他研究者合作開發(fā)生物質譜技術,主要包括肽序列從頭測序的算法開發(fā)、基于電子轉移解離(ETD)譜圖的高效蛋白質鑒定技術、和通過鑒定交聯(lián)肽段來研究蛋白-蛋白相互作用的方法。實驗室裝備的質譜儀包括一臺 Q Exactive和一臺LTQ-Orbitrap-ETD。
代表性文章
Representative Publications
1.????? Li WJ?, Wang CW?, Tao L?, Yan YH?, Zhang MJ, Liu ZX, Li YX, Zhao HQ, Li XM, He XD, Xue Y*, Dong MQ*. (2021) Insulin signaling regulates longevity through protein phosphorylation in Caenorhabditis elegans. Nat Commun. 12(1):4568.
2.????? Jones AX?, Cao Y?, Tang YL?, Wang JH, Ding YH, Tan H, Chen ZL, Fang RQ, Yin J, Chen RC, Zhu X, She Y, Huang N, Shao F, Ye K, Sun RX, He SM, Lei X*, Dong MQ*. (2019) Improving mass spectrometry analysis of protein structures with arginine-selective chemical cross-linkers. Nat Commun. 10(1):3911.
3.????? Chen ZL?, Meng JM?, Cao Y?, Yin JL, Fang RQ, Fan SB, Liu C, Zeng WF, Ding YH, Tan D, Wu L, Zhou WJ, Chi H, Sun RX, Dong MQ*, He SM*. (2019) A high-speed search engine pLink with systematic evaluation for proteome-scale identification of cross-linked peptides. Nat Commun. 10(1):3404.
4.????? Li ST?, Zhao HQ?, Zhang P?, Liang CY, Zhang YP, Hsu AL, Dong MQ* (2019) DAF-16 stabilizes the aging transcriptome and is activated in mid-aged C. elegans to cope with internal stress. Aging Cell. 2019 Feb 17:e12896.
5.????? Ding YH?, Gong Z?, Dong X?, Liu K, Liu Z, Liu C, He SM, Dong MQ*, Tang C*. (2017) Modeling protein excited-state structures from "over-length" chemical cross-links. J Biol Chem. 292(4):1187-1196.
6.????? Tan D?, Li Q?, Zhang MJ, Liu C, Ma C, Zhang P, Ding YH, Fan SB, Tao L, Yang B, Li X, Ma S, Liu J, Feng B, Liu X, Wang HW, He SM, Gao N, Ye K, Dong MQ*, Lei X*. (2016) Trifunctional cross-linker for mapping protein-protein interaction networks and comparing protein conformational states. eLife. 2016 Mar 8;5. pii: e12509.
7.????? Lu S?, Fan SB?, Yang B?, Li YX, Meng JM, Wu L, Li P, Zhang K, Zhang MJ, Fu Y, Luo J, Sun RX, He SM*, and Dong MQ*. (2015) Mapping Native Disulfide Bonds at a Proteome Scale. Nature Methods 12(4):329-31.
8.????? Shen EZ?, Song CQ?, Lin Y?, Zhang WH, Su PF, Liu WY, Zhang P, Xu J, Lin N, Zhan C, Wang X, Shyr Y, Cheng H*, Dong MQ* (2014) Mitoflash frequency in early adulthood predicts lifespan in Caenorhabditis elegans. Nature 508(7494): 128-132.
9.????? Tao L, Xie Q, Ding YH, Li ST, Peng S, Zhang YP, Tan D, Yuan Z*, Dong MQ* (2013) CAMKII and Calcineurin Regulate the Lifespan of Caenorhabditis elegans through the FOXO Transcription Factor DAF-16. eLife 2:e00518.
10.?? Yang B?, Wu YJ?, Zhu M?, Fan SB?, Lin J, Zhang K, Li S, Chi H, Li YX, Chen HF, Luo SK, Ding YH, Wang LH, Hao Z, Xiu LY, Chen S, Ye K, He SM*, and Dong MQ* (2012) Identification of Cross-linked Peptides from Complex Samples. Nature Methods 9(9): 904-906.